丹鳳縣古為殷契所封之國，為商國。商、周時為古鄀國地，春秋時為楚地，公元前351年為秦國占領。
前340年為商鞅封地，名商邑。前337年更商邑置商縣（治今古城村），轄今商州區及丹鳳、商南、山陽縣大部。漢元鼎四年（前113）割境西置上雒縣，三國魏改為上洛縣（在今商州市），時商縣轄區為今丹鳳、商南、山陽三縣大部。西晉泰始二年（226）分境南置豐陽縣（今山陽縣）。北魏景明元年（500）于境東置南商縣（今商南縣）。
隋文帝開皇4年（584），改商縣為商洛縣，轄今地與商南縣地，治今古城村。
唐武德2年（619），移商洛縣治于金陽村（今商鎮）。
金貞元2年（1154），更商洛縣為商洛鎮，屬上洛縣。
元至正元年（公元1264年），廢上洛縣，今地屬商州。
清乾隆二十六年（1761），設州同駐龍駒寨（今陜西丹鳳縣龍駒寨鎮），屬商州直隸州，1912年廢。
民國四年（1915），設商縣縣佐，駐龍駒寨，至民國二十年（1932）撤銷。民國三十五年（1946），設陜西省第四區行政督察專員兼保安司令公署龍駒寨辦事處。民國三十七年（1948），撤辦事處，建立陜西省龍駒設治局（屬三等縣建制），治所龍駒寨鎮（今陜西丹鳳縣龍駒寨鎮）。
1949年6月1日，建立丹鳳縣，縣治龍駒寨，初隸豫陜鄂邊區陜南行政主任公署商洛分區；1950年2月，改隸陜西省商洛專區。1958年12月撤縣，轄地分別并入商縣、商南、山陽縣。1961年10月1日，丹鳳縣正式恢復，隸陜西省沒洛專員公署。
1981年元月15日，復改為丹鳳縣人民政府，隸屬陜西省商洛行政公署商洛地區。
2002年開始屬商洛市。
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